MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1

Total Repeats: 53441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004567	GAA	3	9	241	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031103
2	NC_004567	GA	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	380031103
3	NC_004567	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031103
4	NC_004567	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031103
5	NC_004567	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	380031103
6	NC_004567	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031103
7	NC_004567	GTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031103
8	NC_004567	GAAT	2	8	582	589	50 %	25 %	25 %	0 %	380031103
9	NC_004567	TAAT	2	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	380031103
10	NC_004567	A	6	6	610	615	100 %	0 %	0 %	0 %	380031103
11	NC_004567	AGG	2	6	617	622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	380031103
12	NC_004567	GAA	2	6	631	636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031103
13	NC_004567	TTA	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031103
14	NC_004567	CGA	2	6	663	668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031103
15	NC_004567	T	6	6	676	681	0 %	100 %	0 %	0 %	380031103
16	NC_004567	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031103
17	NC_004567	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	380031103
18	NC_004567	GAT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031103
19	NC_004567	CGAA	2	8	776	783	50 %	0 %	25 %	25 %	380031103
20	NC_004567	AAT	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031103
21	NC_004567	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031103
22	NC_004567	GAAA	2	8	1151	1158	75 %	0 %	25 %	0 %	380031103
23	NC_004567	ACTG	2	8	1212	1219	25 %	25 %	25 %	25 %	380031103
24	NC_004567	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031103
25	NC_004567	TCA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031104
26	NC_004567	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	380031104
27	NC_004567	ACC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031104
28	NC_004567	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031104
29	NC_004567	CAA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031104
30	NC_004567	A	7	7	1800	1806	100 %	0 %	0 %	0 %	380031104
31	NC_004567	AGA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031104
32	NC_004567	AAT	2	6	2125	2130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031104
33	NC_004567	ATG	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031104
34	NC_004567	GAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031104
35	NC_004567	AAT	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031104
36	NC_004567	CAG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031104
37	NC_004567	AAT	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031104
38	NC_004567	ACGATT	2	12	2440	2451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	380031104
39	NC_004567	AAC	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031104
40	NC_004567	AAG	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031104
41	NC_004567	CGTT	2	8	2563	2570	0 %	50 %	25 %	25 %	380031104
42	NC_004567	GAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031104
43	NC_004567	AT	3	6	3239	3244	50 %	50 %	0 %	0 %	380031105
44	NC_004567	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031105
45	NC_004567	GGT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031105
46	NC_004567	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031105
47	NC_004567	GTTA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	25 %	0 %	380031105
48	NC_004567	GAT	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031105
49	NC_004567	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031105
50	NC_004567	TTGAAG	2	12	3385	3396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031105
51	NC_004567	T	6	6	3408	3413	0 %	100 %	0 %	0 %	380031105
52	NC_004567	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	380031106
53	NC_004567	AATT	2	8	3619	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	380031106
54	NC_004567	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031106
55	NC_004567	GCG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031106
56	NC_004567	AGCG	2	8	3718	3725	25 %	0 %	50 %	25 %	380031106
57	NC_004567	ATC	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031106
58	NC_004567	TATGGA	2	12	3845	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031106
59	NC_004567	AAC	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031106
60	NC_004567	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031106
61	NC_004567	ATC	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031106
62	NC_004567	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031106
63	NC_004567	GTCG	2	8	4148	4155	0 %	25 %	50 %	25 %	380031106
64	NC_004567	CAA	3	9	4191	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031106
65	NC_004567	GAC	2	6	4220	4225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031106
66	NC_004567	TTA	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031106
67	NC_004567	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031106
68	NC_004567	TGA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031106
69	NC_004567	TTA	3	9	4380	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031106
70	NC_004567	CTG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031106
71	NC_004567	ATTA	2	8	4502	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	380031106
72	NC_004567	GAG	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	380031106
73	NC_004567	CGAAAA	2	12	4570	4581	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	380031107
74	NC_004567	ATG	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
75	NC_004567	ACG	2	6	4682	4687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031107
76	NC_004567	CCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031107
77	NC_004567	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
78	NC_004567	TGA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
79	NC_004567	ATA	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031107
80	NC_004567	A	6	6	4845	4850	100 %	0 %	0 %	0 %	380031107
81	NC_004567	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031107
82	NC_004567	GGT	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031107
83	NC_004567	TGG	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031107
84	NC_004567	GTT	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
85	NC_004567	ATC	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031107
86	NC_004567	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031107
87	NC_004567	TGA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
88	NC_004567	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031107
89	NC_004567	ACC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031107
90	NC_004567	GAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031107
91	NC_004567	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
92	NC_004567	ATAAGA	2	12	5295	5306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	380031107
93	NC_004567	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	380031107
94	NC_004567	GAC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031107
95	NC_004567	TGA	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
96	NC_004567	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031107
97	NC_004567	TACG	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	380031107
98	NC_004567	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031107
99	NC_004567	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031107
100	NC_004567	TTG	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
101	NC_004567	TGT	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
102	NC_004567	GCA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031107
103	NC_004567	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031107
104	NC_004567	A	6	6	5785	5790	100 %	0 %	0 %	0 %	380031107
105	NC_004567	ACA	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031107
106	NC_004567	GTA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
107	NC_004567	GTT	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
108	NC_004567	GAA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031107
109	NC_004567	GGT	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031107
110	NC_004567	ATTA	2	8	6079	6086	50 %	50 %	0 %	0 %	380031107
111	NC_004567	GTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
112	NC_004567	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031107
113	NC_004567	GAA	2	6	6251	6256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031107
114	NC_004567	TGAG	2	8	6258	6265	25 %	25 %	50 %	0 %	380031107
115	NC_004567	GTT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
116	NC_004567	GCG	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031107
117	NC_004567	TGA	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
118	NC_004567	TCT	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	380031107
119	NC_004567	GT	3	6	6511	6516	0 %	50 %	50 %	0 %	380031107
120	NC_004567	ACGT	2	8	6791	6798	25 %	25 %	25 %	25 %	380031108
121	NC_004567	CGG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031108
122	NC_004567	AAG	2	6	6874	6879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
123	NC_004567	TTG	2	6	6890	6895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031108
124	NC_004567	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031108
125	NC_004567	ATG	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
126	NC_004567	CAG	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031108
127	NC_004567	ACA	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031108
128	NC_004567	ATT	2	6	7402	7407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031108
129	NC_004567	AT	3	6	7476	7481	50 %	50 %	0 %	0 %	380031108
130	NC_004567	ATG	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
131	NC_004567	CGG	2	6	7603	7608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031108
132	NC_004567	AAG	2	6	7754	7759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
133	NC_004567	GAA	2	6	7791	7796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
134	NC_004567	TGA	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
135	NC_004567	ATT	2	6	7867	7872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031108
136	NC_004567	GAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
137	NC_004567	TAGC	2	8	8054	8061	25 %	25 %	25 %	25 %	380031108
138	NC_004567	ATT	2	6	8080	8085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031108
139	NC_004567	GAA	2	6	8089	8094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
140	NC_004567	TGAAGA	2	12	8166	8177	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	380031108
141	NC_004567	GAA	4	12	8185	8196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
142	NC_004567	GTG	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031108
143	NC_004567	ATG	3	9	8300	8308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
144	NC_004567	GAC	2	6	8328	8333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031108
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146	NC_004567	TCA	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031108
147	NC_004567	A	6	6	8468	8473	100 %	0 %	0 %	0 %	380031108
148	NC_004567	GAT	3	9	8620	8628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
149	NC_004567	ATC	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031108
150	NC_004567	ACG	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031108
151	NC_004567	CGA	2	6	8706	8711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031108
152	NC_004567	GAT	2	6	8770	8775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
153	NC_004567	TCA	3	9	8822	8830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031108
154	NC_004567	AAAC	2	8	8848	8855	75 %	0 %	0 %	25 %	380031108
155	NC_004567	GTG	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031108
156	NC_004567	GAA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
157	NC_004567	GAC	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031108
158	NC_004567	AAG	2	6	8963	8968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
159	NC_004567	GAT	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
160	NC_004567	TGA	2	6	9123	9128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
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162	NC_004567	TTAC	2	8	9885	9892	25 %	50 %	0 %	25 %	380031109
163	NC_004567	CGA	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031109
164	NC_004567	TGC	2	6	9916	9921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031109
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166	NC_004567	TTAAC	2	10	10056	10065	40 %	40 %	0 %	20 %	380031109
167	NC_004567	TGC	2	6	10078	10083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031109
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171	NC_004567	GCC	2	6	10265	10270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	380031110
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242	NC_004567	CAAT	2	8	13406	13413	50 %	25 %	0 %	25 %	380031113
243	NC_004567	AGC	2	6	13440	13445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031113
244	NC_004567	TGA	2	6	13500	13505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031113
245	NC_004567	GTT	2	6	13510	13515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031113
246	NC_004567	GTT	2	6	13548	13553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031113
247	NC_004567	CAAA	2	8	13569	13576	75 %	0 %	0 %	25 %	380031113
248	NC_004567	AAC	2	6	13750	13755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031114
249	NC_004567	CAC	2	6	13775	13780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031114
250	NC_004567	GC	3	6	13881	13886	0 %	0 %	50 %	50 %	380031114
251	NC_004567	TTA	2	6	13963	13968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031114
252	NC_004567	GAT	2	6	13987	13992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031114
253	NC_004567	TGG	2	6	13995	14000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031114
254	NC_004567	CTA	2	6	14055	14060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031114
255	NC_004567	GCG	2	6	14091	14096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031114
256	NC_004567	ATG	2	6	14144	14149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031114
257	NC_004567	TTA	2	6	14161	14166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031114
258	NC_004567	GAA	2	6	14257	14262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031114
259	NC_004567	ATG	3	9	14282	14290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031114
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496	NC_004567	CAAG	2	8	28267	28274	50 %	0 %	25 %	25 %	380031123
497	NC_004567	TCAAA	2	10	28339	28348	60 %	20 %	0 %	20 %	380031123
498	NC_004567	ATC	2	6	28419	28424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031123
499	NC_004567	GGC	2	6	28468	28473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031123
500	NC_004567	GTC	2	6	28517	28522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031123

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